През 2002 г. градината става обект на съдебен спор между СУ „Св. Климент Охридски" и манастира „Св. Св. Константин и Елена" в едноименния морски курорт.

Страна в съдебния спор е и фирмата „Сийланд пропъртийс" АД, на която манастирът още същата година е прехвърлил голяма част от оспорваните земи (над 200 дка) срещу коли и 250 хил. лв.

Ботаническата градина не е включена в защитените зони по „Натура 2000".
Към момента Ботаническата градина е вписана в проекта за ОУП на гр. Варна като курортен комплекс, а не като Екопарк. А това означава само едно - строителство!

Ботаническа градина във Варна хармонично съчетава изкуствени и естествени екосистеми. Тя е създадена през 1977 г. на територията на съществуващ разсадник, а от 11 май 2002 г. е отворена за посещение и е обявена официално за първия в страната и на Балканите екопарк с обща площ 90 акра. Паркът предлага богато разнообразие от екзотични дървета и храсти - повече от 250 вида от четири континента, както следва: Европа- 123 вида, Азия - 87 вида, Северна Америка - 40 вида, Азия - 1 вид.

Източник: Дарик